Da hans familie flytter fra deres hjem i Berlin til et mærkeligt nyt hus i Polen, bliver den unge Bruno venner med Shmuel, en dreng, der bor på den anden side af hegnet, hvor alle ser ud til at bære stribede pyjamas. Uvidende om Shmuels skæbne som jødisk fange eller om den rolle, hans egen nazistiske far spiller i hans fangenskab, begiver Bruno sig ud på en farlig rejse ind bag lejrens mure.
