Efter at have tilbragt det meste af sit liv i junglen med sine forældre flytter Dora til byen for at stå over for sin hidtil mest dristige udfordring: gymnasiet. Som en født opdagelsesrejsende finder Dora sig snart i at lede aben Boots, sin fætter Diego og sine venner på et eventyr for at redde sine bortførte forældre og løse et mysterium knyttet til en fortabt inka-by.
